IRLi allakäigutrepp

4. juunil 2006 kiitis ühinemise heaks mõlema erakonna üldkogu. Ametlikult registreeriti uus erakond 15. novembril 2006.

21. oktoobril 2006 kinnitas ühenderakonna volikogu Mart Laari ametlikult peaministrikandidaadiks.

Aprill 2007 Pronksiöö. Tallinnas puhkesid rahutused pärast seda, kui Tõnismäelt viidi kalmistule ära nn pronkssõdur. Andrus Ansipi juhtimisel võttis rahvus-konservatiivse poliitsuuna IRLilt paljuski üle Reformierakond.

26. mail 2007 valiti 986 poolthäälega erakonna esimeheks sellele ametikohale ainsana kandideerinud Mart Laar.

Märtsis 2007 riigiikogu valimistel kogus erakond 98 203 häält ehk 17,9 protsendi valijate toetuse. See tähendas parteile 19 kohta parlamendis. Võrreldes Isamaaliidu ja Res Publica tulemustega 2003. aasta riigikogu valimistel kaotati kokku 16 kohta, seda peamiselt Res Publica tugevalt kahanenud populaarsuse tõttu.

Juuli 2011 puhkes sisekriis ehk kampsunite mäss, kui eelkõige endise Isamaa tiiva vanemad esindajad eesotsas Tõnis Lukase ja Andres Herkeliga ähvardasid erakonnast lahkuda.

2011. aasta novembris puhkes nn elamislubade skandaal, kui „Pealtnägija“ paljastas, et selles oli oma roll ka IRLiga seotud poliitikute Indrek Raudse ja Nikolai Stelmachi äriühingul. Mõlemad lahkusid poliitikast, kuid jälg jäi. (Toimetus on artiklit muutnud ja täiendanud 19.02.2020. Riigiprokuratuuri 2012. a algatatud kriminaalmenetlus, uurimaks kas äriühingute välismaalastest osanikud võisid esitada Politsei- ja Piirivalveametile valeandmeid ettevõtluseks tähtajalise elamisloa taotlemisel, mille käigus muuhulgas käsitleti ka Stelmachile kuulunud äriühingu võimalikke seoseid uuritud tegevustega, lõpetati aasta hiljem, kuna äriühingute välismaalastest osanike poolset valeandmete esitamist ei tuvastatud).

28. jaanuaril 2012 valiti erakonna uueks esimeheks Urmas Reinsalu.